Większość masek N95 jest również materiałami eksploatacyjnymi. Stosowane w celu zapobiegania chorobom zakaźnym powodowanym przez wirusy, bakterie, grzyby i inne patogeny rozprzestrzeniające się w powietrzu, maski N95 nie są zalecane przez długi czas, w przeciwnym razie patogeny mogą gromadzić się na powierzchni maski. Maski zanieczyszczeń znacznie zmniejszyły jego zdolność do zapobiegania i kontroli.
Dlatego ogólnie zaleca się noszenie maski przez ponad 4 godziny i wymianę jej na czas. Jeśli maska jest uszkodzona lub mokra, należy ją wymienić na czas. W przeciwnym razie mikroorganizmy mogą przenikać do wewnętrznej powierzchni, co powoduje, że bakterie na wewnętrznej powierzchni maski przekraczają standard i nie zapewniają dobrego efektu obronnego.